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洪水过后有瘟疫的原因可能是自然灾害引发的饥荒、饮用水匮乏等会造成人体免疫力下降、生化方面的污染、灾难后自然环境剧变导致的环境微生态变化、灾民聚集地环境、专业医疗支援力度、资源匮乏等多方面造成瘟疫或传染病的大面积爆发。
洪水过后的消杀工作十分重要，只有这样，才能最大限度减少灾后传染病的发生和传播。我们不仅要积极应对洪灾的原生灾害，更要预防洪灾后出现传染病。洪水过后有瘟疫的原因可能是自然灾害引发的饥荒、饮用水匮乏等会造成人体免疫力下降、生化方面的污染、灾难后自然环境剧变导致的环境微生态变化、灾民聚集地环境、专业医疗支援力度、资源匮乏等多方面造成瘟疫或传染病的大面积爆发。
生化污染是指生物化学方面的污染，说通俗点也就是动物尸体腐败后产生的有毒有害气、液体的渗透、扩散，对灾区卫生状况造成的极坏的影响。生物腐败后产生的气、液体，带有大量有毒物质的同时，还携带有数量及其庞大的致病菌，如革兰氏菌、牙孢杆菌等致死性极强的细菌都会存在，在尸体液化后，有毒物质和大量致病菌将会随着尸水渗透至地下水层或扩散到空气种，污染水源和灾区大气。同时，尸体腐败时招来的蝇虫等生物，也会携带大量致病菌四处传播。
并且受灾民众通常会自发或有组织的聚集在相对安全的区域中生活或等待救援，这个相对安全的区域由于各种原因，导致其面积狭小、人口密度极高且卫生条件极差。灾民往往在灾难后心理、体力双重透支，由于物资有限，灾民吃饭、保暖、休息等都得不到保障，而老鼠、蟑螂等四害也会在灾民聚集地泛滥，牲畜、宠物又缺乏监管，四处游荡，乱吃乱喝，成为积极致病源，为疾病散播提供了有利的条件。
洪灾过后，往往引发各种疾病的传播和流行。这些常见的疾病有：伤寒、肝炎、霍乱、痢疾、感染性腹泻等肠道传染病；疟疾、乙型脑炎等因蚊虫叮咬而传播的疾病;流行性出血热、钩端螺旋体病;食用霉变食物而引起的食物中毒；与患有疾病的家畜如牛、马、羊、猪的接触机会增多，可能传播给人；长江中下游血吸虫流行区，洪水时钉螺面积扩大，接触阳性螺区疫水，易发生血吸虫病急性感染。
